По умолчанию комиссию оплачивает магазин.
Для того, чтобы частично или полностью переложить комиссию на клиента необходимо перейти в меню Настройки магазина - Магазин - блок Лимиты и комиссии
Кликните на иконку "карандаша". В всплывающем окне укажите необходимые настройки и сохраните их.