На сайты созданные с помощью инструмента "Интернет-магазин" можно добавить метатеги и фавикон.
В меню Платежные-инструменты - Интернет-магазин перейдите в настройки интернет-магазина.
Далее необходимо перейти в блок Инфо
Для интернет-магазина можно указать Название (Title), Описание (Description), Ключевые слова (Keywords), Заголовок H1
Также можно добавить свой фавикон для сайта.